Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Xrcc3Q9CXE6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms