Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Yif1bQ9CX30 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Yif1bQ9CX30 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Yif1bQ9CX30 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms