Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pfdn1Q9CWM4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Pfdn1Q9CWM4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn1Q9CWM4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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