Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp2Q9CUU3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp2Q9CUU3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms