Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp13a2Q9CTG6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp13a2Q9CTG6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms