Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d3Q9CSV6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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