Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snw1Q9CSN1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms