Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska2Q9CR46 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska2Q9CR46 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms