Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PclafQ9CQX4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms