Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim8Q9CQQ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim8Q9CQQ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms