Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer1Q9CQL2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer1Q9CQL2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms