Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufb9Q9CQJ8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufb9Q9CQJ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms