Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrps17Q9CQE3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrps17Q9CQE3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms