Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpa3Q9CQ71 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms