Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cmc1Q9CPZ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms