Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl17Q9CPR4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl17Q9CPR4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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