Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn6Q99PL6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms