Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim3Q99PE5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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