Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cep41Q99NF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cep41Q99NF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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