Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b1Q99NB9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b1Q99NB9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms