Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl1Q99N96 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl1Q99N96 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms