Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Hdac9Q99N13 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac9Q99N13 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms