Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mccc1Q99MR8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms