Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1b4Q99ME6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms