Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprtQ99M80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprtQ99M80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprtQ99M80 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
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