Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms