Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Sh3bp5lQ99LH9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5lQ99LH9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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