Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp16Q99LG0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms