Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abcf2Q99LE6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcf2Q99LE6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms