Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd3Q99LE3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd3Q99LE3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms