Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pagr1aQ99L02 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms