Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn2aQ99KJ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubxn2aQ99KJ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms