Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sfxn1Q99JR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms