Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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