Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec3Q99J72 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apobec3Q99J72 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms