Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Slc8b1Q925Q3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc8b1Q925Q3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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