Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Csmd1Q923L3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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