Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clip1Q922J3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clip1Q922J3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms