Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf3Q920N1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms