Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rpe65Q91ZQ5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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