Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Pde6cQ91ZQ1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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