Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atl3Q91YH5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms