Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcdha8Q91Y12 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha8Q91Y12 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms