Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac11Q91WA3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac11Q91WA3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms