Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep1Q91W92 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep1Q91W92 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms