Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usb1Q91W78 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usb1Q91W78 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms