Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp3Q91W36 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms