Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd3Q91W18 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd3Q91W18 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms