Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps3Q91VB4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms