Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApofQ91V80 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms